Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK7Q16549 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms