Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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