Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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