Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms