Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SEC23BQ15437 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SEC23BQ15437 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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