Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms