Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CHD4Q14839 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CHD4Q14839 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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CHD4Q14839 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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CHD4Q14839 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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CHD4Q14839 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHD4Q14839 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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