Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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