Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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