Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK13Q14004 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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