Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms