Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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