Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTN1Q12860 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms