Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CXCL9Q07325 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms