Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXC5Q00444 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms