Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms