Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms