Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BGRP55822 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms