Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMARCA2P51531 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms