Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms