Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MMP12P39900 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MMP12P39900 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MMP12P39900 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MMP12P39900 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms