Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBRP36941 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LTBRP36941 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms