Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMA4P25789 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms