Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD247P20963 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD247P20963 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD247P20963 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms