Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA1P20827 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms