Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms