Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD8P13378 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD8P13378 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms