Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHGAP10645 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHGAP10645 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms