Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms