Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRATO95237 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRATO95237 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms