Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPLO60437 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPLO60437 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPLO60437 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPLO60437 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPLO60437 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPLO60437 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms