Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRICKLE3O43900 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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