Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLX3O43711 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLX3O43711 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLX3O43711 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLX3O43711 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TLX3O43711 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TLX3O43711 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms