Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPA4Q9UI42 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPA4Q9UI42 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms