Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RDH8Q9NYR8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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