Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FBXL12Q9NXK8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FBXL12Q9NXK8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms