Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSPNQ9HAW4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms