Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM15Q9C019 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms