Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FOXQ1Q9C009 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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