Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHMP4AQ9BY43 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHMP4AQ9BY43 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHMP4AQ9BY43 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHMP4AQ9BY43 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHMP4AQ9BY43 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4AQ9BY43 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms