Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms