Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NUP58Q9BVL2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms