Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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