Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3GL3Q99963 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms