Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms