Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC10A4Q96EP9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms