Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms