Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLHC1Q8NHS4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLHC1Q8NHS4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLHC1Q8NHS4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLHC1Q8NHS4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLHC1Q8NHS4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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