Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEST4Q8NFU0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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