Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTL3Q8N8U3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms